于都县医疗保险管理局是县政府管辖的一个职能单位，归属于县人力资源和社会保障局管理的正科级单位，成立于2002年7月，主要工作职责和业务范围有：宣传贯彻落实、医疗、工伤、生育保险和离休干部医疗保障服务管理的政策法规，负责制订工作计划，承办保险业务和离休干部医疗费单独统筹管理工作，负责办理团体补充医疗保险及其他各类补充医疗保险的各项业务工作。对全县定点医院、定点零售药店实行协议管理。现有编制31个，其中科级职数1名，副科级职数3名，股级职数8名。

经费来源为全额拨款，性质为行政事业单位。